Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARHGAP28Q9P2N2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGAP28Q9P2N2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms