Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms