Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP1Q9NZI2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms