Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TOR4AQ9NXH8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms