Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RHBDL2Q9NX52 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.2 ms