Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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