Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LHX9Q9NQ69 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LHX9Q9NQ69 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms