Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRMS1Q9HCU9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms