Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLSPNQ9HAW4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLSPNQ9HAW4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms