Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CLMPQ9H6B4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms