Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MIXL1Q9H2W2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms