Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KLHL4Q9C0H6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms