Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
AMBRA1Q9C0C7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms