Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KRT23Q9C075 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT23Q9C075 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms