Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP8

PAPPA2, Pappalysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA2Q9BXP8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PAPPA2Q9BXP8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPPA2Q9BXP8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms