Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GATA5Q9BWX5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GATA5Q9BWX5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms