Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPATA9Q9BWV2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms