Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PBDC1Q9BVG4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PBDC1Q9BVG4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms