Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NICN1Q9BSH3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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