Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SDF4Q9BRK5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDF4Q9BRK5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms