Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CPPED1Q9BRF8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms