Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LPIN3Q9BQK8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LPIN3Q9BQK8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms