Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms