Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms