Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MEIS3Q99687 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms