Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRBNQ96SW2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRBNQ96SW2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms