Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PCNX1Q96RV3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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