Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRC7Q96NW7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC7Q96NW7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms