Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms