Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHAMP1Q96JM3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms