Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIRT1Q96EB6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms