Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RFT1Q96AA3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms