Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLA-CQ95604 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms