Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms