Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DCAF4Q8WV16 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms