Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HELBQ8NG08 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELBQ8NG08 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms