Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME9Q86XW9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME9Q86XW9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms