Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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TRAPPC6BQ86SZ2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TRAPPC6BQ86SZ2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRAPPC6BQ86SZ2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRAPPC6BQ86SZ2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TRAPPC6BQ86SZ2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TRAPPC6BQ86SZ2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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