Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
WDR53Q7Z5U6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms