Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms