Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTF1AQ7RTS3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms