Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMIM5Q71RC9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMIM5Q71RC9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms