Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP31Q70CQ4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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