Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LINC00173Q6ZV60 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms