Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSS7

MFSD6, Major facilitator superfamily domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD6Q6ZSS7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD6Q6ZSS7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD6Q6ZSS7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms