Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAPN12Q6ZSI9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms