Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ABRAXAS1Q6UWZ7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms