Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC4Q6P2E9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms