Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF123Q5XPI4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF123Q5XPI4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms