Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUSD4Q5VX71 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms